Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crocc2F6XLV1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms