Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms