Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20671F6TVX7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms