Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

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Length 2,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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BC067074F6RXI4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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BC067074F6RXI4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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BC067074F6RXI4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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BC067074F6RXI4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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BC067074F6RXI4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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BC067074F6RXI4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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