Protein–RNA interactions for Protein: E9Q501

Gm2237, Predicted gene 2237, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2237E9Q501 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2237E9Q501 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2237E9Q501 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2237E9Q501 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2237E9Q501 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2237E9Q501 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2237E9Q501 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2237E9Q501 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2237E9Q501 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms