Protein–RNA interactions for Protein: E9Q257

Gm8237, Predicted gene 8237, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8237E9Q257 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm8237E9Q257 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm8237E9Q257 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm8237E9Q257 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm8237E9Q257 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm8237E9Q257 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm8237E9Q257 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm8237E9Q257 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm8237E9Q257 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm8237E9Q257 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm8237E9Q257 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm8237E9Q257 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm8237E9Q257 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm8237E9Q257 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm8237E9Q257 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8237E9Q257 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8237E9Q257 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm8237E9Q257 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Gm8237E9Q257 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8237E9Q257 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8237E9Q257 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8237E9Q257 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm8237E9Q257 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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