Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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Gm3250E9Q1M3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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