Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo5cE9Q1F5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms