Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms