Protein–RNA interactions for Protein: E9Q007

Gm4450, Predicted gene 4450, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4450E9Q007 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm4450E9Q007 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm4450E9Q007 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm4450E9Q007 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm4450E9Q007 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm4450E9Q007 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gm4450E9Q007 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4450E9Q007 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gm4450E9Q007 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Gm4450E9Q007 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gm4450E9Q007 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gm4450E9Q007 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4450E9Q007 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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