Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx60E9PZQ1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms