Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf11E9PZM7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms