Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms