Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc8E9PWG2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms