Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms