Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gcn1E9PVA8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gcn1E9PVA8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gcn1E9PVA8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gcn1E9PVA8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gcn1E9PVA8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gcn1E9PVA8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Gcn1E9PVA8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gcn1E9PVA8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gcn1E9PVA8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gcn1E9PVA8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gcn1E9PVA8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms