Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gm3543D3Z235 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm3543D3Z235 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm3543D3Z235 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3543D3Z235 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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