Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc5C3VPR6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms