Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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