Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gm20547B8JJN0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm20547B8JJN0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm20547B8JJN0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm20547B8JJN0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm20547B8JJN0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm20547B8JJN0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm20547B8JJN0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm20547B8JJN0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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