Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprbB2RU80 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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