Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zscan5bB2RTN3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zscan5bB2RTN3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms