Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Brpf1B2RRD7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms