Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Zbed5B2RPU8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Zbed5B2RPU8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Zbed5B2RPU8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Zbed5B2RPU8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Zbed5B2RPU8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Zbed5B2RPU8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Zbed5B2RPU8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Zbed5B2RPU8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Zbed5B2RPU8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed5B2RPU8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms