Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ssxb8B1AY40 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ssxb8B1AY40 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ssxb8B1AY40 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ssxb8B1AY40 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ssxb8B1AY40 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ssxb8B1AY40 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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