Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm5640A3KG49 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm5640A3KG49 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm5640A3KG49 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm5640A3KG49 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm5640A3KG49 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm5640A3KG49 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm5640A3KG49 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm5640A3KG49 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm5640A3KG49 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5640A3KG49 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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