Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga8A2ARA8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga8A2ARA8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms