Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syndig1A2ANU3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms