Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GabreA2AMW3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms