Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam43bA2AM80 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms