Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frmpd1A2AKB4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frmpd1A2AKB4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms