Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin3aA2AIR5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms