Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbbp8nlA2ABX0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms