Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Prdm16A2A935 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Prdm16A2A935 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
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Prdm16A2A935 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Prdm16A2A935 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Prdm16A2A935 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Prdm16A2A935 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm16A2A935 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms