Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb4A2A863 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Itgb4A2A863 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms