Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Trav12-2A0N8N6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Trav12-2A0N8N6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Trav12-2A0N8N6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Trav12-2A0N8N6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trav12-2A0N8N6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trav12-2A0N8N6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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