Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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Trbv30A0A0B4J1P1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Trbv30A0A0B4J1P1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Trbv30A0A0B4J1P1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Trbv30A0A0B4J1P1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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