Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms