Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm4T1NXB5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms