Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms