Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crlf3Q9Z2L7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms