Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms