Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms