Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3b1Q9Z1T1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms