Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms