Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn9Q9Z0S7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Cldn9Q9Z0S7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn9Q9Z0S7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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