Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms