Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Clcn5Q9WVD4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn5Q9WVD4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn5Q9WVD4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn5Q9WVD4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn5Q9WVD4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn5Q9WVD4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn5Q9WVD4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn5Q9WVD4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn5Q9WVD4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn5Q9WVD4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn5Q9WVD4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn5Q9WVD4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn5Q9WVD4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn5Q9WVD4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms