Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stxbp4Q9WV89 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stxbp4Q9WV89 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms