Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme3Q9WV85 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms